Sur le FractalWiki, on entend par souswiki un wiki autonome et détaché abrité à l'intérieur d'un gros wiki.
Les usages peuvent se montrer pratiques pour une organisation comme une école qui souhaiteraient par exemple construire un wiki pour l'école et un sous-wiki par classe, quitte à donner à chaque élève son WikiPersonnel pour y stocker ses travaux personnels.
Ce type d'usage peut se décliner dans l'organisation. L'intérêt essentiel est de pouvoir mutualiser des ressources documentaires et faciliter les "ponts" sur une même plate-forme tout en préservant l'intimité de chacune des entités sous-communautaires ou personnelles.